Movable Typeを移行時に復元でフルバックアップを作成し以降する方法がありますが、移行先でblogが既に存在しているとでblog idが変更されて復元してしまいます。
Movable Typeのblog idは下記のように作成された順番に連番で作成されます。

１番目に作成したblog = blog_id=1
2番目に作成したblog = blog_id =2
3番目に作成したblog = blog_id = 3

しかし、上記blogを復元でBackupを取り移行する時、移行先に既にblogが存在している場合、移行後のidは下記のように変更されてしまいます。

移行先に既に存在しているblog = blog_id = 1
１番目に作成したblog = blog_id=2
2番目に作成したblog = blog_id =3
3番目に作成したblog = blog_id = 4

これを防ぐには、移行する前に、移行先のblogをすべて削除しておく必要があります。
blog idでNewsや最新記事のFeedを取る事が多いので、復元して移行する時は気をつけたほうが良さそうです。

と思ったけど、blogを削除してもIDが変更されてしまいます。。
まだ、解決してないですが、分かればアップします。